Σύμφωνα με τα όσα διαρρέονται από το περιβάλλον του προέδρου της ΠΑΕ Παναθηναϊκός, το θέμα με δικαστική υπόθεση στις 13 Νοεμβρίου, που ο Γιαννακόπουλος είναι κατηγορούμενος για απειλές και ύβρεις σε βάρος των διαιτητών του τελικού Κυπέλλου Ελλάδας, με τον Ολυμπιακό, έπαιξε μόλις για 10 δευτερόλεπτα. Επίσης, δεν έγινε αναπαραγωγή σε άλλη εκπομπή ή δελτίο του τηλεοπτικού σταθμού.
Παράλληλα, η πλευρά Αλαφούζου υπογραμμίζει πως η εκπομπή «Η Δίκη στον ΣΚΑΪ» είναι «αυτόνομη». Προσθέτει, επίσης, ότι αυτό πιστοποιείται από το γεγονός ότι ειπώθηκε η θέση της ΠΑΕ Ολυμπιακός, που χαρακτήριζε τον Γιάννη Αλαφούζο «μανιοκαταθλιπτικό». Τέλος, τονίζεται πως στην εκπομπή έγινε αναφορά και στην υπόθεση των Μαρινάκη-Θεοδωρίδη.
