Ο Παναγιωταράκος αγωνίστηκε στο «τριφύλλι» από το 1961 έως το 1972, φορώντας τη φανέλα με το νούμερο 12, ενώ υπήρξε αρχηγός της ομάδας. Με την πράσινη φανέλα κατέκτησε έξι πρωταθλήματα Ελλάδος (’62, ’67, ’69, ’71, ’72, ’73).
Το 1969 συμμετείχε στα ημιτελικά του Κυπέλλου Κυπελλούχων (ο ΠΑΟ αποκλείστηκε από την Ντιναμό Τιφλίδας) ενώ το 1972 στα ημιτελικά του Κυπέλλου Πρωταθλητριών (αποκλεισμός από Ίνις Βαρέζε).
Με την Εθνική αγωνίστηκε 54 φορές, έχοντας συνολικά 404 πόντους. Ήταν παρών φορώντας το εθνόσημο, στα Βαλκανικά πρωταθλήματα του ’62, ’63, ’64, και ’66, στο Ευρωμπάσκετ του 1965 και σε δύο Προολυμπιακά τουρνουά (’64, ’68).
Από αριστερά προς τα δεξιά: Παναγιωταράκος, Πέππας, Κολοκυθάς, Χαϊκάλης, Πολίτης.