Η Ακαδημία του ποδοσφαιρικού τμήματος της ΠΑΕ Παναθηναϊκός σε συνεργασία με το πρωτοποριακό κέντρο αποκατάστασης Φιλοκτήτης, διεξάγει ένα δυναμικό σύστημα παρακολούθησης σύμφωνα με το οποίο εφαρμόζονται καινοτόμα πρωτόκολλα ανάλυσης και χορηγούνται εξατομικευμένα προγράμματα πρόληψης τραυματισμών στους νεαρούς ποδοσφαιριστές.
Οι αθλητές υπό την επίβλεψη του Βιοχημικού Άσκησης Γιάννη Τσεκούρα, της Αθλητικής Διαιτολόγου Τόνιας Μαχαίρα, του ιατρού Γεράσιμου Σίννη και του επιτελείου των φυσικοθεραπευτών της ομάδος του Παναθηναϊκού Μάνου Κασαπάκη, Σταμάτη Χατζή και Γιάννη Γρυπάρη αλλά και του ειδικά καταρτισμένου προσωπικού του Φιλοκτήτη, υποβάλονται σε εξειδικευμένες ασκήσεις αξιολόγησης δύναμης, ταχύτητας και άλματος.
Ο εργομετρικός και αιματολογικός έλεγχος θεωρείται πλέον απαραίτητος για τον καταρτισμό του προπονητικού προγράμματος για τη βελτίωση της αθλητικής απόδοσης και την πρόληψη των τραυματισμών ενός επαγγελματία αθλητή. Συνδυαστικά αποτελούν ένα πολύ δυνατό εργαλείο στα χέρια ενός προπονητή, ο οποίος δουλεύει βάσει των σύγχρονων απαιτήσεων του πρωταθλητισμού ρυθμίζοντας σε εξατομικευμένη βάση τις εντάσεις των προπονήσεων σύμφωνα με τις ανάγκες του κάθε ποδοσφαιριστή αλλά και γενικότερα ολόκληρης της ομάδας ανάλογα με την εκάστοτε αγωνιστική περίοδο.